История

1962 г – Клубът е създаден от работници на строителната площадка на бъдещия Нефтохим. В същата година отборът започва в „А“ окръжна група под името «Строител».
1964 г – Tимът окончателно приема името Нефтохимик.
1965 г – Отборът влиза в „Б“ група.
1967 г–  Официално е открит стадион „Нефтохимик“ с мач между младежките отбори на България и Финландия.
1970 г – През Януари с решение на ЦК на БКП в Бургас се взема решение да бъде създаден обединен бургаски клуб. Нефтохимик е закрит, а най-добрите му играчи ги пращат в Черноморец.

1970 – 1981 г – Клубът участва само в работнически първенства и турнири. През 1978става работнически шампион

1981 г – на 6 май, след като стадионът на ЖСК Локомотив (Бургас) е разрушен, се взема решение отборът, който е създаден през 1932 година и има нужда от стадион, да се обедини с Нефтохимик.
1986 г – на 29 януари Клубът се регистрира като самостоятелно юридическо лице по Закона за лицата и семейството 1986 година.
1987 г – Отборът заема трето място в турнира за купата на България

1991 г – Финалист за Купата на БФС

1994 г. – Нефтохимик заема 1-во място в Южната „Б“ група и за пръв път в историята си се класира за „А“ група. От 1994-та до 1999-та година включително, стадион Нефтохимик е най-посещаван от зрителите в България.

1995 г.  – Полуфинал  в турнира за купата на България.

1996 г – Носител на купата ПФЛ. Най-резултатно нападение в А ПФГ за спортно – състезателната 1995/1996 година

1997 – Вицешампион на България в спортно-състезателната 1996/1997 г. Носител на купата на ПФЛ.  Най-резултатно нападение в А ПФГ. Първо участие в европейските клубни турнири.

2000 г – Финалист за Националната купа.  В спора за златото Нефтохимик губи от Левски (Сф) с 0:2. Участието на финала дава право на клуба за втори път да играе в евротурнирите.

2002 г – Клубът става собственост на «Петрол Холдинг», променя името си на „Нафтекс“
2006 г– Полуфинал за купата на България. Отборът изпада в „Б“ група.
2007 г – Отборът губи бараж да влизане в А група
2009 г – Клубът е разпуснат, като почти всички футболисти от представителния отбор и децата от ДЮШ преминават в новосъздадените клубове Черноморец ( ПМ ) и/ или Черноморец-Бургас ( Бургас ) .
– Със съдействието и на Община Бургас и строителна компания «Евробилдинг» , «ПФК Нафтекс“ се обединява с ФК „Атлетик“ и променя името си на « ФК Нефтохимик 1986″.
2010 г– през зимата на 2010 година бургаските бизнесмени Николай Филипов и Валентин Каравълчев купуват ФК Нефтохимик 1986 . Благодарение на стабилното финансово обезпечаване отбора успява да изпълни целите поставени пред него и се завръща в Източна Б професионална футболна лига.
– отборът печели купата на Аматьорската футболна лига

2011 г – Носител на Купата на Аматьорската футболна лига.  Mалко след края на сезона в ЮИ „В“ група, където Нефтохимик завършва на втора позиция, бургаският клуб бива поканен за участие в бараж за класиране в Източната „Б“ група. „Зелено-белите“ поечелят с 1:0 над Септември (Тервел) в Сливен и се завръщат сред професионалистите.
2013 г – Отборът става шампион в Източната Б група и печели промоция за А група.

2014 г

– ПФК Нефтохимик изпада в Б група. След като не получава лиценз за участие в групата за шампионат 2014-2015 , собствениците преустановяват финансирането и клубът спира с развитието на мъжки футбол. В последствие отказва участие и във В футболна група.

– На 16.07.2014 група привърженици на отбора създават СНЦ “ Футболен клуб Нефтохимик Бургас 1962″, като основната цел е да се запази марката Нефтохимик и да се продължи съществуването на детско-юношеската школа. Постигната е договорка със собствениците на ПФК Нефтохимик  новия клуб да получи нематериалните активи на клуба и така да се запази приемствеността между клубовете.

2015 г/2016г 

През януари 2015 е обявено бъдещото обединение между ФК Нефтохимик Бургас 1962 и професионалния ПФК Бургас. Двете ръководства се обединяват в идеята за изграждането на един силен футболен клуб Нефтохимик, който да върне блясъка на футбола в града.

Юни 2015 – обединението е факт. ПФК Бургас се преименува на ПФК Нефтохимик Бургас 1962, а сдружението СНЦ „ФК Нефтохимик Бургас 1962“ гласува влизането , като акционер в новосъздадения клуб.

Отборът се състезава в „Б“ Професионална футболна група и завършва на 12-то място с актив от 38 точки.

На 5 юли 2016 г. ИК на БФС утвърждава разформироването на „А“ ФГ, „Б“ ФГ и „В“ АФГ. На тяхно място се създават Първа професионална лига, Втора професионална лига и Трета лига. Новата Първа лига е в състав от 14 отбора. За участие в нея подават заявки 10-те отбора, осигурили си място в „А“ ФГ в края на миналия сезон, както и още 4 отбора от по-долните дивизии, в това число и Нефтохимик Бургас.  Заявките на всички 14 отбора са одобрени.

Така отборът стартира новия шампионат, като част от новосъздадената Първа професионална лига.

2016/2017

Нефтохимик записва първо участие в новосъздадената Първа професионална лига. Изпада във Втора професионална лига под ръководството на Христо Янев същата година.

2017/2018

Нефтохимик стартира участието си във Втора лига с много неясноти относно бъдещето на клуба. Въпреки лошото финансиране и  натрупаните задължения от участието си в Първа професионална лига, отборът стартира своето участие в шампионата. За съжаление отборът не успява да се пребори за оставане в групата и изпада в Трета лига.